ينتقل الفيلم مباشرة بعد Scorpion's Revenge حيث يتم مهاجمة الأبطال من قبل Shao Kahn ، الأمر الذي سيجبر "Raiden ومجموعته من المحاربين على عقد صفقة للمنافسة في Mortal Kombat النهائية التي ستحدد مصير العوالم". هذا يجبر الأشخاص الطيبين على السفر إلى Outworld للدفاع عن Earthrealm بينما يسافر Scorpion للعثور على Kamidogu (بقايا صوفية صنعها آلهة كبار السن) قبل استخدامها لإعادة الكائن الغامض الذي سيدمر الكون.
